异基因造血干细胞移植是目前输血依赖性地中海贫血唯一广泛应用的治愈性疗法。目前移植总体生存率在90%以上，但仍认为是一种高风险治疗手段，需要详细了解移植相关事宜，尽量降低移植相关死亡率。
(1) 指征
输血依赖性地中海贫血是移植的主要指征。
(2) 时机
儿童期最适合，造血干细胞移植宜尽早进行，以避免长期贫血及铁过载相关的并发症。
(3)禁忌症
如果患儿器官功能正常，并能耐受手术，没有绝对禁忌症。若患者有铁过载引起的重度器官损伤，如非代偿性肝硬化，一般不建议移植。
移植前准备及评估
（1）未行移植前
继续规范地高量输血（血红蛋白维持在90-100g/L以上）及铁鳌合治疗。如正在使用其他减少输血需求的药物，可继续进行。
（2）脾切除术
出现输血需求急剧增加、脾功能亢进、脾梗死或脾静脉血栓形成等情况时需要脾切除治疗。脾切除一般在年龄满4-6岁以后进行。如移植前评估，由造血干细胞移植专科医生评估患儿脾脏增大明显，可能影响移植效果，增加移植风险，可根据移植医生建议行脾切除手术。
（3）移植供体选择
目前随着医学发展，缺乏供体已不在目前阻碍患者移植的因素。
● 同胞：
HLA全相合的同胞是理想的供者。同胞移植前行地贫基因检查，排除重型地中海贫血可作为供者。
● 无亲缘关系供体：
如无HLA相合的同胞供体，通常需要从骨髓登记库找相合的供体。
● 脐血：
同胞脐血或HLA相合非亲缘脐血供体在一些有经验的移植中心也有很高的生存率。根据年龄、铁过载等指标对疾病进行分层，脐血作为供体，已发挥较好的优势。
● 半相合亲缘供体：
如无以上三种供体，父母或HLA不相合的亲缘同胞也可作为造血干细胞移植供体，移植前进行预处理方案调整，也有较高的生存率。
（4）移植前器官功能评估
移植前需要进行抽血评估基本的脏器功能、凝血功能、传染性疾病筛查、巨细胞病毒、EB病毒等，为移植前做准备。移植前需通过血清铁蛋白、MRI等评估铁过载情况。还需进行X线、心电图、B超、心脏彩超等评估实质器官的功能。
（5）内分泌功能评估
由于长期的铁过载可能造成内分泌功能受损。对10岁以上的患者进行内分泌评估，检测空腹血糖水平、甲状腺功能并进行生长激素释放激素刺激试验等检查，希望移植前发现胰腺、甲状腺和垂体中铁沉积导致的内分泌缺陷。这些评估不会影响移植结局，但对移植后的长期治疗非常有用。
不需要进行外科手术。造血干细胞移植需要对患者放疗或者药物化疗进行预处理，最后将供体造血干细胞通过静脉输注到患者体内，重建患者的造血功能和免疫功能，达到治疗目的。
（1）口腔黏膜炎
移植期间的放化疗及感染可能造成黏膜损伤，口腔黏膜炎通常会引起疼痛、进食减少，降低生存质量。故尽可能按医护治疗，做好口腔护理，尽量减少发现口腔黏膜炎的机率及严重度。
（2）血细胞减少
放化疗、免疫等因素造成白细胞减少、贫血及血小板降低，白细胞降低增加感染风险，贫血会造成面色苍白精神疲倦，血小板降低会增加出血风险。故定期随诊，医生会根据血象情况进行相应治疗。
（3）感染
移植前需要抑制免疫治疗，移植后使用免疫抑制预防排斥反应，这些都会造成机体免疫功能降低，移植后免疫重建需要很长一段时间，移植后的感染往往比较严重，最常见的感染为肺部感染及胃肠道感染，故开始移植后做好手卫生、正确佩戴口罩、合理饮食减少感染风险。如出现发热、剧烈咳嗽、气促、腹泻、呕吐、血便及精神差等，需要及时就诊，避免因疾病加重造成不可挽回的结局。
（4）急性移植物抗宿主病（aGVHD）
aGVHD可能发生在皮肤、肠道或肝脏。表现为皮疹、水泡、呕吐、腹泻、腹痛、血便或黄疸。aGVHD可根据严重程度分为1-4度，3-4度的aGVHD往往较严重，花费高，且部分可能导致死亡，故移植后需按时服药，移植早期定期随诊，如出现aGVHD症状尽早就诊。
（5）其他早期并发症
移植后早期还可能出现的并发症，如血栓性微血管病、肝小静脉闭塞综合征、出血性膀胱炎、巨细胞病毒血症等。这些并发症的发生轻重不一。地中海贫血的患者还可能出现高血压、高血糖的情况。故再次强调移植后定期复诊的重要性。
移植期间的饮食目前没有统一标准，原则上需要食材新鲜、清洗干净并充分加热，食物均衡搭配。如出现胃肠道症状：如呕吐、腹痛、腹泻情况，可能需要使用流质、半流食饮食，利于肠道吸收，减轻肠道负担，尽量保证营养摄入。对于不能经口进食患者，可能需要管饲或肠外营养。
患者年龄越大、铁过载程度越高、供者匹配度越低，则风险越高。随着目前移植水平的发展，这类风险目前也在逐渐降低。患者和家属/陪护者的价值观与意愿、移植中心的经验及成本在决定移植后的并发症发生及风险方面也起很大作用。
造血干细胞移植和常规内科治疗均有风险。移植后早期的移植相关并发症和死亡风险较高，但90%以上的地中海贫血患者都能治愈，在经验丰富的移植中心，生存率还可能更高。内科治疗须持续终生，且有长期输血(同种异体免疫反应、输血反应)和螯合治疗(神经毒性、肾毒性等)的相关风险。