大理市红十字会机关设2个内设机构，分别是：党政办公室、赈济救护科。

1.党政办公室。负责机关日常运转、综合协调和对外联络等工作;承担机关党的建设、党风廉政建设、财务、资产、干部人事、后勤服务及群团等工作;负责意识形态、安全保密、信访、政务公开、综治维稳和创建示范工作;负责红十字会宣传工作;承担各级、社会各界捐赠资金、物资的筹集、调配、监管等工作;承担红十字会基层组织建设、红十字青少年、红十字事业发展等工作;承担大理市红十字会监事会日常事务工作。

2.赈济救护科。负责备灾救灾、应急救护、人道救助、救援等工作，拟订相关制度、发展规划措施并组织实施;负责开展应急救护培训及应急救援体系建设，普及应急救护、防灾避险知识等;负责开展生命健康安全教育，普及卫生健康知识等;承担应急救援相关储备物资管理工作;承担全市范围内应急救援志愿服务队伍建设和管理服务工作，并负责统筹组织调度志愿者参与突发公共事件的应急救助和现场救护等工作;参与推动无偿献血、遗体和人体器官捐献工作，参与开展造血干细胞捐献的相关工作。