遗体捐献后遗体的处理方式取决于捐献的具体情况和协议约定。以下是不同情况下的处理方式：

1.仅器官捐献：接收单位摘取捐献器官后，会将遗体交还给家属，由家属按照殡葬规定办理火化、安葬等事宜，确保遗体尊严得到维护。

2.遗体整体捐献：接收单位会根据捐赠协议和医学需求，将遗体用于医学教学、科研（如解剖实验、疾病研究等）；使用完毕后，接收单位通常会统一进行火化，并可根据家属意愿提供骨灰安葬服务（部分单位提供集体安葬或家属自行领取骨灰安葬）。

3.器官与遗体同时捐献：先摘取捐献器官用于临床移植，剩余遗体再按遗体捐献的流程用于医学教学或科研，最终由接收单位统一火化。

此外，遗体捐献后，使用过的遗体一般会进行火化处理，以防止疾病的传播和有害物质对环境造成污染。火化后，骨灰可以按捐献者或家人的意愿处理，如安葬或带回等。

需要注意的是，遗体捐献过程中可能存在一些特殊情况或例外情形，如捐献者生前改变意愿、接收单位未按协议处置遗体、遗体因特殊情况无法按原计划处理等，这些都可能影响遗体的最终处理方式。

如果您有意向捐献遗体，建议详细了解相关程序和法律规定，并与当地红十字会或相关医学机构进行沟通，以确保您的意愿能够得到尊重和实现。